L’établissement est géré par un directeur général nommé par l’Etat et chargé de préparer et de mettre en œuvre la politique de l’établissement. 

Pour cela, il dispose d’une équipe spécialisée pour la négociation foncière, l’acquisition des biens et leur gestion, structurée en trois pôles :

• Opérations foncières, contact : 02 99 86 74 23
• Etudes, contact : 02 99 86 34 93
• Administration-finances. contact : 02 99 86 34 96

L’équipe compte également un comptable public, issu du ministère des finances, qui assure l’exécution des recettes et des dépenses de l’établissement et contrôle son activité comptable.